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Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique
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Numérique, mathématiques
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Santé, biologie et vieillissement
Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire (MEDyC)
Unité de recherche
UMR CNRS 7369
L'Unité Mixte de Recherche (URCA – CNRS) « Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire » (UMR CNRS 7369 MEDyC) est un laboratoire de référence mondiale dans le domaine de la biologie de la Matrice Extracellulaire (MEC), avec de nombreuses collaborations nationales et internationales, tant académiques que industrielles. Ses travaux de recherche, centrés sur une approche post-génomique des interactions entre les cellules et la MEC, ont mis en lumière le rôle crucial de la MEC dans le contrôle du remodelage tissulaire, tant dans des conditions normales que pathologiques. En particulier, leurs travaux ont permis de décrypter les mécanismes qui modulent la progression tumorale ainsi que les phénomènes de vieillissement de la MEC, ces derniers contribuant de manière significative au développement de diverses pathologies cardiovasculaires.
Ce projet de recherche pluridisciplinaire, à l'interface entre la physique, la biologie et la bioinformatique, vise à identifier de nouvelles cibles pharmacologiques et de nouveaux biomarqueurs.
Il vise également à développer des molécules à fort potentiel d'application permettant de lutter contre la progression tumorale et les pathologies vasculaires associées au vieillissement, ouvrant la voie à une pharmacologie issue de la matrice extracellulaire ainsi qu'au développement de nouveaux outils pour le diagnostic et le pronostic. Certaines molécules font de plus l'objet de programmes de co-développement avec Apmonia Therapeutics, une start-up issue du laboratoire, afin d'accélérer leur transfert clinique.
L'Unité MEDyC s'articule autour de trois équipes :
- Équipe 1 : Matrice Extracellulaire, Cancer et Cibles Thérapeutiques : qui se concentre sur l'étude des mécanismes de remodelage de la matrice extracellulaire par les enzymes protéolytiques. Grâce à plusieurs modèles in vivo et in vitro, elle cherche à comprendre comment ces processus influencent la progression tumorale et explore des cibles thérapeutiques potentielles.
- Équipe 2 : Vieillissement Matriciel et Remodelage Vasculaire : qui se focalise sur les mécanismes impliqués dans le remodelage vasculaire lié au vieillissement de la matrice extracellulaire des gros vaisseaux. Leurs recherches se concentrent sur les modifications post-traductionnelles non-enzymatiques tardives des protéines de la MEC et sur la protéolyse matricielle, en étudiant leur rôle dans les pathologies associées.
- Équipe 3 : Modélisation et Imagerie Multi-échelles : qui a pour objectif de fournir au reste de l’unité de nouveaux outils basés sur des approches novatrices issues de la bioinformatique, telles que la modélisation par homologie, la dynamique moléculaire, l'arrimage moléculaire et les interactions molécules/molécules. En complément, elle recourt à la virtualisation faisant appel à la spectroscopie moléculaire, afin de proposer des solutions et des outils adaptés à l’exploration de systèmes complexes aux différentes échelles caractérisant le vivant.
MEDyC est également impliqué dans le développement de l’axe Bioéconomie de l’URCA, à la fois de par ses activités de valorisation de molécules agrosourcées et leurs applications potentielles en cosmétique et en thérapeutique contre les pathologies tumorales et vasculaires, ainsi que par sa contribution au développement d’outils de screening et d’analyse d’interactions moléculaires.
Profil d'activité
VALORISATION ET INNOVATION Transformation des résultats en applications concrètes et diffusion des connaissances | 30% |
TRAVAIL DE RECHERCHE Tels que la réalisation d’études, la production de connaissances et la formation à la recherche | 50% |
CONSEILS ET EXPERTISE TECHNIQUE Appui technique pour les entreprises, collectivités locales, organisations gouvernementales, non gouvernementales et internationales | 20% |
Thématiques stratégiques
Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique
- Agronomie, aliments, nutrition
- Médicaments biosourcés
Santé, biologie et vieillissement
- Recherche clinique
- Cancérologie expérimentale et translationnelle
- Cibles thérapeutiques et médicaments
- Bio-Ingénieries
- Ingénierie biomédicale, biomécanique
- Numérique en santé
- Maladies inflammatoires chroniques et immunités
- Imagerie biomédicale
- Pathologies cardiovasculaires
Numérique, mathématiques
- Intelligence artificielle
- Modèles déterministes ou stochastiques, simulation numérique
- Matrice extracellulaire
- MEC
- Approches à l’interface physique-biologie-bioinformatique
- Mécanismes moléculaires
- Interactions cellules-matrice extracellulaire
- Nouvelles cibles pharmacologiques
- Nouvelles molécules à forte potentialité d’applications thérapeutiques
- Matrikines anti-tumorales
- Molécules anti-vieillissement tissulaire
- Pharmacologie ciblée
- Diagnostic
- Pronostic
- Approche post-génomique
- Progression tumorale
- Vieillissement de la matrice extracellulaire
- Maladies dégénératives
- Paroi artérielle
- Remodelage de la matrice extracellulaire
- Enzymes protéolytiques
- Signalome
- Modifications post-traductionnelles tardives non-enzymatiques des protéines
- Glycoxydation
- Carbamylation
- Diabète sucré
- Insuffisance rénale chronique
- Protéolyse matricielle accrue
- Fragmentation de l’élastine
- Rigidité vasculaire
- Formation de calcifications
- Athérosclérose
- Thrombose
- Cancer
- Pathologies vasculaires
- Modélisation moléculaire par homologie
- Imagerie multiéchelle
- Modélisation multiéchelle
- Dynamique moléculaire
- Arrimage moléculaire
- Interactions molécules/molécules
- Spectroscopie moléculaire
- Bioinformatique structurale
- Imagerie Très Haute Résolution par Synchrotron
Campus Moulin de la Housse
Bât. 18, Chemin des Rouliers
51100 Reims
- Pôle Santé - 51 rue Cognacq-Jay, 51100 Reims
Expertises / Savoir-faire
Biologie cellulaire :
- Cultures cellulaires
- Étude des interactions cellule-matrice extracellulaire en conditions physiologiques et pathologiques in silico, in vitro et in vivo
- Signalisation cellulaire
Biologie moléculaire et biochimie :
- Biologie moléculaire
- Toutes analyses de biochimie
- Caractérisation d’interactions moléculaires
- Conformations de biomolécules (polymères, acides nucléiques, protéines)
Physicochimie et microanalyse :
- Physicochimie à l’échelle de la cellule vivante isolée
- Microanalyse quantitative non destructive sur systèmes biologiques, cellulaires, matériaux inorganiques et biomatériaux
Modélisation et informatique :
- Modélisation moléculaire
- Développements informatiques (traitements de données, traitement d’images, analyse discriminante)
Ingénierie et imagerie :
- Ingénierie instrumentale et cellulaire
- Imagerie fonctionnelle et moléculaire du vivant (cellulaire, tissulaire, intra-vitale)
Expérimentation animale :
- Modèles génétiquement modifiés en cancérologie (ex.TSP1,…) et cardiovasculaire (ex.APOE- ,dbdb-,ldlr-,…)
Projets représentatifs
Start-up créées :
- Apmonia Therapeutics
Projets internationaux :
COST (VascAgeNet) – Horizon Europe MSCA (HEPINIB, GreenCosmin) – PHC-ALmaqdissi – EUR Nanophot 2020 ‐ 2030 (PIA 4)
Projets nationaux :
- ANR THROMBOCARB (2025 - 2029)
- ANR NANOMATRIX (2025 - 2028)
- ANR EMOTREMA (2025 - 2027)
- ANR RAVA (2025 - 2027)
- ANR GLUTACARE (2025 - 2028)
- ANR BIOScreen Target (2024 - 2028)
- ANR MODELAGE (2024 - 2027)
- PSCI Aviesan-ITMO Cancer «Radio-TME-Targeting » (2024)
- MITI 2024 Défi Pollution et dépollution : solutions et trajectoires. « PEPPY : Protein/Emerging-PFAS Interactions »
- FORCE NBI (2023 - 2027)
- Fondation de France (2023 - 2025)
- ANR THROMBOTAX (2022 - 2026)
- ANR SMARTBONEORGANOID (2021 - 2025)
- ANR Glycotarget (2021 - 2025)
- INCa PLBio RXnanobrain (2021 - 2024)
- PLBIO : Ciblage de l'axe TSP-1/CD47 pour restaurer l'immunité anti-tumorale dans le traitement du carcinome ovarien (2020 - 2025)
- ANR Glycostil (2020 - 2024)
- ANR ExoAGEing (2019 - 2024)
Projets régionaux :
- Contribution à divers Programme d’Investissement d’Avenir (PIA3 et PIA4 EXEBIO)
- Projet FHU ARRIMAGE : Assessment and integrative Research on Remodeling-Inflammation-MetAbolic Stress in systemic and hepatoGastrointestinal mEtabolic diseases
- FHU CARTAGE : “Cardiac and ARTerial AGEing: Innovative and patient-centered strategies”
- SATT-Nord pré-paturation du projet Antapsine en co-développement avec Apmonia – 2022
- SATT-Nord maturation du projet Antapsine en co-développement avec Apmonia – 2023 - 2025
- SATT Nord prématuration du projet "Rôle thérapeutique de l’anticorps monoclonal SAJ22 ciblant tous les isoformes de CD160 dans le cancer du sein" – 2024 - 2025
Partenariats représentatifs
- Entreprises privées
- Académiques
Publications : https://cnrs.hal.science/MEDYC
Brevets
- FR3004936 (2013) : « Procédé d'obtention d'un mélange d'oligosaccharides neutres extraits de graines de lin » – WO, CA, CN, EP, ES, JP, KR, PL, PT, US
- FR2977587 (2011) : « Peptide antagoniste de la liaison entre le CD47 et une protéine appartenant à la famille des thrombospondines » – WO, CA, DK, EP, ES, JP, US
Marchés d'application
- Biotechnologies
- Enseignement / Formation
- Recherche / Science
- Santé / Bien-être
Types d'offres
- Collaboration de R&D
- Formation
- Prestations de conseil
- Prestations de service
Équipements ouverts à la collaboration
- Appareillages pour électrophorèses
- Centrifugeuses
- Chromatographie en phase gazeuse (CPG)
- Chromatographie en phase liquide à haute performance (HPLC)
- Congélateurs -80°C
- Cuves à azote liquide
- Electrophorèse capillaire
- Laboratoires de cultures cellulaires / microbiologie de niveau L2
- Station de manipulation de liquides Tecan
- Système d'extraction et purification de protéines
- Thermocycleur (ou machine PCR)
- Thermocycleur en temps réel (ou machine qPCR)
- Ultracentrifugeuse
Plateforme(s) utilisée(s)
- Plateforme de Cytométrie mobile et biologie moléculaire (MOBICYTE)
- Plateforme d’Imagerie Cellulaire et Tissulaire (PICT)
- Plateforme d’Analyse de composés moléculaires et Transformation énergétique des biomolécules (PlAneT)
- Plateau de Modélisation Moléculaire Multi-échelle (P3M)
- Plateforme de cytométrie en flux (URCACyt)
- Centre de Calcul Régional ROMEO
- Plateforme Matériaux Nano (Nano’mat)
- Plateforme de rayonnement synchrotron (SOLEIL), France
- Plateforme MEANS - Diamond, Grande-Bretagne
- Centres de Calcul FRançais (CINES)
- Centre de calcul de l’Institut du Développement et des Ressources en Informatique Scientifique (IDRIS)
- Centre Régional Informatique et d'Applications Numériques de Normandie (CRIANN)
Nationales :
Technologies clés
Modélisation, simulation et ingénierie numérique
Intelligence artificielle
Ingénierie tissulaire et cellulaire
Nouvelles modalités d'immunothérapie
Imagerie pour la santé
Effectif
Chercheurs permanents
Post-doctorants
Établissements de rattachement
Pôle(s) scientifique(s)
- Pôle Santé
Appartenance à un groupe institutionnel
- Membre du Matrix Biology Europe (MBE)
- Membre de l'International Society of Matrix Biology (ISMB)
- Membre de la Société Française de Biologie de la Matrice Extracellulaire (SFBMEc)
- Membre de la Société Française d’Angiogenèse (SFA)
- Membre de la Nouvelle Société Francophone d’Athérosclérose (NSFA)
- Membre du Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire (GGMM)
- Membre du Réseau Européen Latinorum Investigatorum de Arteriis Colloquium (LIAC)
- Membre de l'International Society for Clinical Spectroscopy (CLIRSPEC)
- Réparer l’humain : Matériaux et Procédés pour Applications médicales
- COSM’ACTIFS (GDR 3711)
- Cellules Souches et Médecine Régénérative (CeSMeR), International Research Network (IRN-CNRS) franco-chinois
Membre de diverses organisations scientifiques française et européennes :
Membres des GDRs :