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  • Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique
  • Santé, biologie et vieillissement
  • Sociétés contemporaines: évolutions, régulations et expérimentations

EpidemioSurveillance et CirculAtion des Parasites dans les Environnements (ESCAPE)

Unité de recherche
UR 7510

Présentation générale

L’Unité de Recherche multisite « EpidémioSurveillance et CirculAtion de Parasites dans les Environnements » (ESCAPE), dont le site de Reims est également appellé « Pathogènes – Environnement – Toxoplasme – Arthropodes – Réservoirs – bioDiversité » (PETARD), est reconnue au niveau national et international pour son expertise dans la caractérisation des pathogènes et des insectes vecteurs, de leur mode de circulation au sein des environnements où ils évoluent ainsi que dans leur détection en conditions naturelles. Cette caractérisation étant indispensable pour améliorer la compréhension des risques de transmission à l’homme et à l’animal (concept One Health), elle l’est donc aussi au développement de stratégies de prévention ou de diagnostic à grande échelle et à visée thérapeutique.

    Dans cette perspective "One Health", l'unité concentre ses travaux sur l'épidémiologie moléculaire de la cryptosporidiose animale et humaine, en évaluant différents marqueurs génétiques épidémiologiques et pathologiques, ainsi que la pathogénicité et le traitement des protozoaires Cryptosporidium et d'autres protozoaires hydriques tels que Giardia et Acanthamoeba. Sont également étudiées les voies cellulaires et moléculaires impliquées dans la diarrhée déclenchée par Cryptosporidium. L’unité se focalise également sur des agents pathogènes (arbovirus, leishmanies) transmis par des insectes vecteurs (Phlébotomes, moustiques, Culicoïdes) responsables de maladies affectant la santé humaine comme la santé animale.

      Dans le domaine des thérapies antiprotozoaires innovantes, des recherches sont également menées sur l'activité et les mécanismes d'action de nouveaux thiazolides sur les interactions Cryptosporidium - cellule hôte et l'activité du PHMB et des azoles sur le traitement de la kératite à Acanthamoeba.

        Pour mener à bien son projet, l’équipe est structurée autour de 3 axes :

        • L’Axe 1 « Protozoaires » étudie la circulation dans l’environnement ainsi que la pathogénicité de trois parasites protozoaires: Cryptosporidium spp, Giardia intestinalis et Toxoplasma gondii. Les domaines d’expertise de cet axe sont parties intégrantes de l’UMT Protorisk fondée en partenariat avec ACTALIA, centre technique en agro-alimentaire.
        • L’Axe 2 « Métazoaires » concentre son étude sur la systématique des vecteurs étudiés (Phlébotomes, moustiques et culicoïdes) en décrivant de nouvelles espèces pour la Science et en proposant de nouvelles classifications ainsi que sur les pathogènes transmis par les Phlébotomes et par les moustiques, et d’autre part sur la reconnaissance, l’identification et la compréhension des cycles parasitaires d’helminthes à risque zoonotique.
        • L’Axe 3 « Transversal » est en lien direct avec les axes I et II du projet et est orienté autour du développement et valorisation d’outils et techniques d’analyses et de diagnostics, notamment avec l’identification des agents protozoaires parasites de l’axe 1 et l’identification des agents infectieux développée dans l’axe 2.

        Il vise à répondre aux objectifs suivants :

        • Optimisation de l’identification des métazoaires et protozoaires étudiés par une approche intégrative pour permettre la création de bases de données de référence pour la reconnaissance et l'identification de ces agents rares et mal connus ;
        • Développement d’outils pour évaluer la circulation des agents pathogènes dans des conditions naturelles afin d'améliorer la gestion des risques, les conséquences économiques et les questions environnementales liées à ces agents pathogènes.

        Contacts

        • M. Jérôme DEPAQUIT
          Directeur d'unité de recherche

        Thématiques stratégiques

        Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique

        • Médicaments biosourcés
        • Santé environnementale
        • Qualité environnementale
        • Biodiversité et évolution

        Santé, biologie et vieillissement

        • Recherche clinique
        • Mesure et évaluation en santé publique
        • Stress cellulaire et environnemental
        • Cibles thérapeutiques et médicaments
        • Numérique en santé
        • Santé globale

        Sociétés contemporaines: évolutions, régulations et expérimentations

        • Changement climatique
        • Recherche participative

        Plan et accès

        Pôle Santé
        51 Rue Cognacq-Jay
        51100 Reims

        Autres villes d'implantation
        • 76 - Rouen

        Expertises et projets

        Expertises / Savoir-faire

        Modèles expérimentaux et études fonctionnelles :

        • Cultures cellulaires / parasitaires
        • Production et commercialisation d’antigènes (T. gondii, Poumon d’éleveurs d’oiseaux)
        • Expertise en Entomologie et en Parasitologie médicale et vétérinaire
        • Description de nouvelles espèces
        • Etablissement de collections de référence
        • Expertise en éco-éthologie
        • Épidémiologie de terrain (captures, échantillonnage) en France et à l’étranger

        Biologie moléculaire et immunologie :

        • Purification de protéines
        • Electrophorèse bidimensionnelle
        • Spectroscopie de masse (MALDI-TOF), spectroscopie IR (collaboration avec l’Unité Médyc CNRS UMR 7369)
        • Détection antigène/anticorps (western blot, etc.)
        • Biologie moléculaire (conventionnelle et en temps réel)
        • Cytométrie en flux
        • Immunoséparation par billes magnétiques

        Projets représentatifs

        Projets internationaux :

        • HORIZON 2020 (CLIMOS)
        • Interreg ORION : une nouvelle approche pour la gestion des écosystèmes aquatiques transfrontaliers de la Meuse
        • ANRS-MIE PRFI EXPECTS : EXploring Phlebotomine sand flies as vectors of arboviruses in South-East Asia cave ECosysTemS

        Projets nationaux :

        • Breaking the Wall (2022 - 2025)
        • TOS-CINTOH (2022 - 2025)
        • Mosquitwo (2021-2024)
        • STRIP (2019 - 2020)

        Projets régionaux :

        • Contribution à divers Programme d’Investissement d’Avenir (PIA4 EXEBIO)
        • Projet SACRYVEG (2020 - 2021)

        Partenariats représentatifs

        • Entreprises privées
        Bio-Evolution / BIO-RAD / Abbott / Actia
        • Académiques
        Universités à l'échelle internationale / Universités à l'échelle nationale
        • Autres
        Institut Pasteur / FranceAgriMer

        Publications : https://hal.univ-reims.fr/ESCAPE-REIMS

        Technologies, services et plateformes

        Marchés d'application

        • Agriculture
        • Agroalimentaire
        • Eau
        • Enseignement / Formation
        • Environnement
        • Recherche / Science
        • Santé / Bien-être

        Types d'offres

        • Collaboration de R&D
        • Formation
        • Prestations de conseil
        • Prestations de service
        • Brevet / Licence

        Équipements ouverts à la collaboration

        • PCR digital - ddPCR, Biorad
        • Spectrophotomètre microvolume UV-visible NanoDrop
        • Microscope optique
        • Fastprep - MP Biomedical
        • Appareillages pour électrophorèses - QIAxcel Advanced, QIAGEN
        • Séquenceur à haut débit (NGS) - MinION, Oxford Nanopore Technologies
        • Extracteur d'acides nucléiques (ADN/ARN) automatisé - QiaCube Connect, QIAGEN
        • Extracteur d'acides nucléiques (ADN/ARN) semi-automatisé sur billes magnétiques - Isolate, Life Technologies
        • Homogénéiseur semi-automatique – BagMixer, Interscience
        • Matériel de piégeage sur le terrain

        Plateforme(s) utilisée(s)

        • High-tech Research infrastructures for Life Sciences (HeRacLeS - IBiSA) : Plateforme de Recherche en IMAgerie CEllulaire de Normandie (PRIMACEN) + Plateforme d’analyse génomique
        • Plateforme de REcherche en Sciences de l’Environnement Normande (PRESEN)
        • Flow cytometry and cell analysis facility (CYFLOW)

        Technologies clés

        • Procédés relatifs à la chimie verte

          • Supercalculateurs

            • Technologies de diagnostic rapide (eau, air, sol)

              • Spectrométrie

                • Cytométrie

                  • Indentification de la pollution des milieux (eau, air, sol)

                    Environnement institutionnel

                    Effectif

                    20-25
                    Effectif total
                    10-15
                    Chercheurs & Enseignants-
                    Chercheurs permanents
                    5-10
                    Doctorants
                    Post-doctorants

                    Établissements de rattachement

                    • Etablissement universitaire - Université de Reims Champagne-Ardenne
                    • Autre rattachement - CHU de Reims
                    • Autre rattachement - CHU de Rouen Normandie
                    • Autre rattachement - ANSES
                    • Autre rattachement - ACTIA
                    • Etablissement universitaire - Université de Rouen Normandie

                    Pôle(s) scientifique(s)

                    • Pôle Santé

                    Appartenance à un groupe institutionnel

                      Membre de diverses organisations scientifiques française et européennes :

                    • Obépine gis
                    • Membre du conseil scientifique actalia
                    • Expert pour anses
                    • Expert EFSA
                    • CNR Toxoplasmose (Reims) - Pilote
                    • CNR Cryptosporidioses microsporidies et autres protozooses digestives (Rouen) - Pilote

                    Écoles doctorales